Butanethiol là một hợp chất hóa học rất độc và ăn da, ở nồng độ cao, nó gây ra các ảnh hưởng nghiêm trọng đến sức khoẻ ở cả người và động vật, đặc biệt là do tiếp xúc kéo dài. Nồng độ cao hơn có thể dẫn đến bất tỉnh và hôn mê sau khi phơi nhiễm kéo dài. Tiếp xúc với da và màng nhầy gây bỏng, và tiếp xúc với mắt có thể dẫn đến thị lực mờ hoặc mù hoàn toàn.

Hít phải có thể gây suy nhược, lú lẫn, ho, chóng mặt, buồn ngủ, nhức đầu, buồn nôn, nôn và thở dốc. Chất gây kích ứng mắt, da, và đường hô hấp. Nó có thể gây ra hiệu ứng trên tuyến giáp và hệ thần kinh và có thể làm giảm ý thức.[6]